建设分公司
公司于2017年11月成立，下设综合管理部、技术管理部、安全质量部、合约管理部、前期工程部、工程一部、工程二部、系统设备部、计划财务部（与集团计划财务部合署办公）9个部门。公司坚持以建设安全、优质、绿色、舒适的“百姓地铁 百年地铁”为己任，着力打造精品工程，全面提升城市品质。
- 负责轨道交通、配套工程（土建、轨道工程、机电设备、装饰装修等）建设及委托项目的建设管理。负责工程的施工策划，项目计划统筹和工程的进度、安全、质量、文明施工、长效管理及投资控制。
- 负责建设及配套项目的土地划拨、征地征收等工作。
- 负责总体设计、初步设计、工程施工图设计与施工图设计阶段的勘察、物探、控制测量、施工图设计审查与咨询、方案变更与施工图设计变更管理、施工技术管理工作，配合建设规划、工程可行性研究工作。
- 负责分公司安全质量、文明施工和长效管理责任体系和保障体系的建立。负责监督参建单位安全生产法规、安全质量管理制度的执行情况和安全生产资金的投入使用情况、整改落实情况。
- 负责分公司层面的应急救援工作,组织或参与分公司安全生产（质量）事故调查及处理；配合地铁保护工作。
- 负责建设工程造价管理工作；负责建设工程的工程量清单修编、计量与支付、现场签证、设计变更、竣工结算等工作。
运营分公司
公司于2015年3月成立，是常州地铁运营的实施主体，现设13个部门、14个生产中心、7个一线班组，办公地点位于丁堰车辆段，主要负责常州地铁开通运营管理以及新线的运营筹备等工作。
- 负责常州地铁1、2号线的日常运营管理工作，包括列车调度、站点管理、安全检查等，确保地铁系统的安全、高效运行。
- 负责新线开通运营筹备，牵头系统设备总联调、试运行及初期运营工作，配合工程建设过程中的协管和临管工作。
- 负责提供优质的客运服务，包括车站引导、乘客咨询、票务服务、热线服务等，提高乘客满意度。
- 负责地铁票务系统的管理和运营，提供高效、便捷的票务服务。
- 负责地铁设备设施的维修及定期维护工作，提高地铁运营的可靠性和安全性。
- 负责运营科研技术创新，鼓励对系统设备核心件的维修及国产化改造开展技术攻关活动。
- 负责运营内部管理，建立落实科学的运营管理体系和安全保障体系。
地铁资源开发有限公司
公司于2024年2月23日成立，是常州地铁集团下属全资子公司，负责地铁资源的综合开发利用。
- 负责轨道交通控制用地征地征收、土地上市等一级开发相关工作。
- 负责轨道交通综合开发用地TOD研究工作。
- 负责固定资产（公司长期持有资产）出租、经营管理等。
- 负责轨道交通资源、衍生产业（包括站点商业、广告、展陈、民用通信、文创等）的策划、开发、招商、经营、管理等。
- 负责图文中心、造价咨询及招标代理服务等市场外拓项目的筹划、实施。
轨道置业有限公司
公司于2020年3月13日成立，是常州地铁集团下属全资子公司，负责轨道交通沿线控制用地项目的二级开发以及地铁车辆段、停车场上盖TOD等的综合开发。
- 负责轨道交通控制用地二级开发项目的投资研究、开发策划定位、地块有关经济技术分析等工作；负责投资风险管控。
- 负责房地产自主开发项目、合作开发项目全过程管理和后期销售管理等。
- 负责相关工程建设管理。
城市服务有限责任公司
公司于2022年2月成立，注册资本3000万人民币，是常州地铁集团下属全资子公司，负责地铁物业管理工作，并承接外部企事业单位的物业管理项目。
- 负责常州地铁正线、场段、商办物业管理工作。
- 承接外部企事业单位物业管理项目。
- 负责商超、咖啡等市场外拓项目运营。
铁盈供应链管理有限公司
公司于2024年8月成立，是常州地铁集团有限公司下属全资子公司，主要负责推动形成内外贯通的供应链服务体系，打通供应链上下游，力争为客户提供快捷、优质、高性价比的产品和服务。